本季故事设定在现代，以第三季《女巫集会》的故事为背景。在一次核爆炸彻底摧毁了世界后，人们建造了一个被称作“第三前哨站”的地下避风港，目的是为了保护拥有强大基因组合的幸存者。维纳布尔（莎拉·保罗森饰）和米德女士（凯茜·贝茨饰）是第三前哨站的主人，对前哨站的管理有一套严格的规则。前哨站的居民，盖兰特（伊万·彼得斯饰）、富家女可可（LeslieGrossman饰）、可可的助手马洛里（比莉·洛尔德饰）、主持人黛娜·史蒂文斯（AdinaPorter饰）等等，在维纳布尔和米德女士残忍的统治下生存。不久后，反基督者迈克尔·兰顿（科迪·费恩饰）的到来打破了前哨站的平静：他要选出有价值的人，带到条件更好的“避难所”生活。但迈克尔绝非好心人，他在晚会上把前哨站的居民毒死了。紧接着，曾经的女巫们出现了——他们带着铲除迈克尔的决心，来到了前哨站，向迈克尔宣战……在“天启”发生的两年前，至尊女巫科迪莉娅（莎拉·保罗森饰）发现自己的魔力正在逐渐流失。而此时她注意到了，男巫学校那边，新晋男巫迈克尔·兰顿的出现，很可能就是导致她日渐衰弱的原因。不久科迪莉娅便发现了他打算毁灭世界的阴谋。为了阻止他得逞，科迪莉娅找回了自己的姐妹，默特尔（弗兰西丝·康罗伊饰）、佐伊（泰莎·法米加饰）、麦迪逊（艾玛·罗伯茨饰）、奎妮（加布蕾·斯迪贝饰）、米丝蒂（莉莉·拉贝饰），还有新加入的马洛里。为了女巫们的安全，科迪莉娅消除了可可和马洛里的记忆，把她们的女巫身份隐藏了起来，以此打入前哨站。女巫和恶魔之子之间的战争一触即发……在不久的将来，核导弹摧毁了世界并开始了核冬天。亿万富翁社交名流可可·圣皮埃尔·范德比尔特 (Coco St. Pierre Vanderbilt) 借助家人的私人飞机，与助手马洛里 (Mallory)、理发师加兰特先生 (Mr. Gallant) 以及祖母埃维 (Evie) 一起逃离了洛杉矶的毁灭。可可的男友布洛克试图搭乘飞机，但被困在洛杉矶。与此同时，一个名为“合作社”的组织根据年轻人的基因构成，选择他们来拯救他们免遭灾难。其中两名被选中的人蒂莫西和艾米丽被送往前哨站 3，这是一个由威廉米娜·维纳布尔女士和她的助手米德女士领导的地下基地。在那里，他们与其他幸存者重聚，包括可可、马洛里、加兰特先生和伊维。前哨站的生活包括严格的规则和严厉的惩罚。十八个月过去了，前哨基地的局势和粮食供应都处于危急状态。合作社的一名男子迈克尔·兰登到来并宣布他将判断谁值得真正被拯救。 兰登向前哨站 3 的客人介绍了自己并解释了他的职责。他向加兰特先生询问他的性取向以及对祖母的仇恨。后来，橡皮人在加兰特的卧室里接近他，伊维发现两人正在做爱。她向米德女士报告了他们的不服从行为。蒂莫西和艾米丽发现最近的合作电子邮件，详细说明了维纳布尔违反正确前哨协议的行为。盖兰特拒绝向维纳布尔透露橡皮人的身份。加兰特向兰登保证他没有透露自己的身份，而兰登则坚称他不是橡皮人，永远不会与他发生性关系。蒂莫西和艾米丽诽谤前哨站 3 的规则，他们第一次发生性关系。橡皮人再次试图引诱盖兰特，盖兰特用剪刀刺伤了他。兰登出现，加兰特发现自己正看着祖母血淋淋的尸体。蒂莫西和艾米丽在床上被捕并被判处死刑。蒂莫西向米德的胃开枪，她的伤口露出了内部线路和白色液体。 兰登向马洛里揭示了他真正的恶魔形态，她让壁炉里喷出火焰。维纳布尔向米德吐露，她没有被选中进入庇护所，米德建议他们杀死所有人。布洛克在一片核荒原上航行，枪杀了一个食人部落。这时，他看到一辆马车驶过。马车将苹果运送到 3 号哨站，维纳布尔决定向它们注射毒液。布洛克潜入前哨站 3 并参加维纳布尔的万圣节化装舞会。可可以为布洛克就是穿着戏服的兰登，引诱他回到自己的卧室。布洛克随后向可可现身，并刺伤了她的额头。前哨站 3 名客人为有毒苹果而疯狂。维纳布尔指示每个人同时等待吃饭。客人们遵照执行，同时也中毒身亡。维纳布尔和米德与兰登对峙，维纳布尔宣布他们将做出选择。米德试图射杀兰登，但发现自己违背维纳布尔的意愿，在兰登的命令下开枪射杀了她。兰登透露，米德是他创造的，她的原型是他童年时的一位看护者，这让她感到安慰。随后，科迪莉亚·古德、麦迪逊·蒙哥马利和默特尔·斯诺降临到 3 号哨站，科迪莉亚复活了马洛里、黛娜和可可。 核爆炸发生前三年，霍桑杰出青年男子学校（一所术士学校，也是未来的前哨站 3）寻找迈克尔·兰登，他因杀害一名侮辱米德模仿对象的男子而被捕，以及逮捕的官员。他经历了数次考验，展现出了惊人的能力。在罗比查克斯小姐的学院，佐伊对马洛里的巫术技巧印象深刻。女巫集会被召集到霍桑开会，科迪莉亚嘲笑大法官关于迈克尔可能是第一位男性至尊者（被称为阿尔法）的怀疑。为了证明自己的力量，迈克尔在科尔特斯酒店将奎妮从永恒的诅咒中拯救出来（科迪莉亚以前无法做到这一点），并将麦迪逊从她的个人地狱中救了出来。 科迪莉亚看到了罗比查克斯小姐学院被毁的可怕景象，并遭到患有疾病的人的袭击。后来，她宣布兰登将夺取七大奇迹，但她为此遭到了默特尔的斥责。马洛里的能力很快增强，科迪莉亚透露她正在死去并慢慢失去她的至高无上的地位。约翰·亨利·摩尔发现了兰登的真实自我，但米德在他警告任何人之前进行了干预并杀死了他。在测试期间，科迪莉亚要求兰登让迷雾日复活，因此兰登将她从个人的地狱中解救出来。据透露，科迪莉亚一直在计划组建一支军队来对抗兰登，并利用他来复活她的学生。后来，科迪莉亚要求麦迪逊和可疑的看哪调查兰登在谋杀屋的起源。 麦迪逊和贝霍尔德假装是已婚夫妇，代表女巫集会购买了谋杀屋。他们施了咒语，迫使房子里的灵魂向他们显现。他们遇到了康斯坦斯·兰登的鬼魂，她同意提供有关她孙子迈克尔的信息，前提是他们将她的宿敌莫伊拉·奥哈拉赶出家门。麦迪逊和看哪挖出了莫伊拉的骨头，并将它们与她母亲的骨头一起埋葬；莫伊拉随后被从房子里释放出来。康斯坦斯告诉他们，她很早就感觉到迈克尔身上有邪恶。在他年轻的时候，他开始杀害动物，然后是他的保姆。迈克尔一夜之间老了十岁，康斯坦斯寻求一位天主教牧师的帮助，但被迈克尔杀死了。出于绝望，康斯坦斯在谋杀屋自杀，在那里她与泰特、博勒加德和她的第四个孩子（一个没有眼睛的小女孩）团聚。麦迪逊和 Behold 随后采访了本·哈蒙和费雯·哈蒙，他们进一步揭示了迈克尔灵魂中的邪恶。薇薇安告诉他们，迈克尔的父亲既不是本，也不是泰特，而是谋杀屋的恶魔。在与 Behold 离开之前，麦迪逊与泰特和维奥莱特重聚。 在巫毒女王黛娜·史蒂文斯的帮助下，科迪莉亚安排与雷格巴爸爸会面，试图阻止兰登的计划。雷格巴透露他拥有南的灵魂，并同意帮助诱捕兰登，条件是科迪莉亚把剩下的女孩的灵魂交给他。科迪莉亚拒绝了，而雷格巴则消失了。为了更多地了解术士和他们的计划，麦迪逊向默特尔的老朋友、女巫女演员巴布斯·麦吉寻求帮助，她擅长解读他人的思想和灵魂。在默特尔举办的一次晚宴上，巴布斯发现爱丽儿和鲍德温知道约翰·亨利的死，并且他们正计划杀死女巫会的妇女。佐伊 (Zoe) 怀疑马洛里 (Mallory) 是真正的下一任 Supreme，因为她救了可可 (Coco)，让她免于窒息，并向科迪莉亚 (Cordelia) 吐露心声。后来，马洛里成功复活了约翰·亨利，并通过了七大奇迹。随后，女巫团抓住了艾丽尔、鲍德温和米德，并因他们的背叛而将他们烧死在火刑柱上。 兰登因米德烧焦的遗体而崩溃，他遇到了科迪莉亚，科迪莉亚告诉他有一个咒语隐藏了米德的灵魂。兰登无法带她回来，于是逃进森林寻求撒旦的指引。兰登虽然没有成功，但仍然坚强但困惑，并被带到城里一座不起眼的撒旦教堂。在教堂，他遇到了玛德琳，玛德琳带他到她家并为他提供食物。在她家里，玛德琳告诉兰登，她通过出卖自己的灵魂获得了生活中的一切。兰登透露他是敌基督者，玛德琳把他带回教堂，会众跪倒在他脚下敬拜。兰登告诉他的追随者，既然米德已经死了，他就没有野心或计划了，尽管他们愿意帮助迎来末日。玛德琳带兰登来到一家由工程师穆特和杰夫经营的机器人公司，他们像其他撒旦教徒一样出卖了自己的灵魂。据透露，维纳布尔女士在核爆炸之前就在该公司工作，穆特和杰夫负责创造米德的机器人。 黛娜帮助兰登和米德渗透入女巫会，以换取撒旦为她的脱口秀开绿灯。米德杀死了大部分女巫，包括奎妮、巴布斯和佐伊。由于兰登摧毁了他们的灵魂，科迪莉亚无法复活他们。剩下的女孩们在米丝蒂的沼泽小屋里避难，桃金娘在那里告诉她们一个可以撤销过去事件的古老咒语。1918 年，默特尔请求马洛里前往俄罗斯，拯救女巫阿纳斯塔西娅·尼古拉耶芙娜大公夫人免遭处决。马洛里拯救阿纳斯塔西娅的尝试失败了，尽管默特尔指出她是第一个成功穿越时空的女巫。由于马洛里几近成功，科迪莉亚考虑自杀，以便马洛里能够成为新的至尊，但默特尔劝阻了她。科迪莉亚和默特尔发现兰登谋杀了霍桑学校的所有术士，包括约翰·亨利和看哪。一直控制米德的穆特和杰夫与兰登会面，并告诉他合作社是古老的光明会，一个由将灵魂出卖给撒旦的世界精英组成的组织。兰登会见了光明会，向他们通报了前哨站的情况，并计划了时代的终结。 在发现兰登的前哨站计划后，巫团决定将可可和马洛里隐藏在前哨站 3，给予他们新的身份，并确保他们在末世中幸存下来，同时马洛里的力量不断增强。在发现黛娜与兰登有牵连后，科迪莉亚、默特尔和麦迪逊将自己埋在沼泽泥里以求在核爆炸中幸存。天启之后，女巫集会面对兰登。当黛娜宣誓效忠兰登时，刚重生的玛丽·拉沃因她的背叛而杀死了她。科迪莉亚随后摧毁了米德，而麦迪逊则射杀了兰登以购买马洛里的时间旅行咒语。当兰登杀死麦迪逊、玛丽和可可时，马洛里被布洛克刺伤，促使科迪莉亚牺牲自己，让马洛里成为新的至尊。马洛里施了咒语，回到了 2015 年，她多次撞倒了年轻的兰登。迈克尔恳求康斯坦斯带他去谋杀屋以保存他的灵魂，但她拒绝了，从而阻止了世界末日的发生。马洛里最终回到罗比查克斯小姐的学院，将奎妮和米斯蒂从未来的命运中拯救出来。与此同时，蒂莫西和艾米丽在新的世界里相遇，几年后，他们生下了一个儿子，后来儿子杀死了他的保姆。安东·拉维、萨曼莎·克罗和米德拜访了他们，声称他们是来帮忙的。